ควบคุม กำกับ ตรวจสอบ การเดินระบบบำบัดน้ำเสียให้เป็นไปตามกระบวนการ
ทางกายภาพ เคมี และชีวภาพของระบบบำบัดน้ำเสียที่กำหนด ควบคุมระบบ บำบัดน้ำเสียให้ดำเนินงานโดยคงสมรรถนะการบำบัดและกำจัดสิ่งสกปรกให้ได้
ตามมาตรฐานที่กำหนด แก้ไขปัญหาอันเกิดจากอุปสรรคในการบำบัดน้ำเสียให้ได้มาตรฐาน รวมทั้งศึกษา
และพัฒนาประสิทธิภาพการบำบัดน้ำเสียให้ดียิ่งขึ้น
ซ่อมบำรุงระบบไฟฟ้า เครื่องกล เครื่องมือวัด ระบบ SCADA และ PLC ของโรงควบคุมคุณภาพน้ำ เพื่อคงสมรรถนะที่ดีทางกายภาพ
และรักษาระบบบำบัดน้ำเสียให้คงประสิทธิภาพเชิงกล และไฟฟ้า บริหารจัดการระบบบำบัดน้ำเสียทั้งในส่วนแผนงานบุคลากร
และงบประมาณ เพื่อให้การเดินระบบ การซ่อมและบำรุงรักษาระบบเป็นไปตามแนวทางที่กำหนด
จัดทำข้อมูลประกอบการเดินระบบ และบำรุงรักษา ตลอดจนค่าใช้จ่ายในการบำบัดน้ำเสีย จัดทำเอกสารเพื่อการจัดซื้อ
จัดจ้าง พร้อมรายละเอียดประกอบเพื่อการซ่อมบำรุง การปรับปรุงระบบ เพื่อพัฒนาประสิทธิภาพระบบบำบัดน้ำเสีย
และระบบรวบรวมน้ำเสีย ดูแล บำรุงรักษา ให้บริการรถบรรทุกผลิตน้ำดื่มได้ ดูแลและบำรุงรักษาหน่วยแก้ไขปัญหาคุณภาพน้ำเร่งด่วน
พร้อมรถสนับสนุน จัดเตรียมข้อมูลเพื่อดำเนินโครงการจ้างเดินระบบ
บำรุงรักษา และบริหารจัดการ โรงควบคุมคุณภาพน้ำ สนับสนุนการป้องกันและแก้ไขปัญหาน้ำท่วมในพื้นที่จุดอ่อนน้ำท่วมของกรุงเทพมหานคร
การบริหารจัดการ กำกับ และดูแลการเดินระบบบำบัดน้ำเสีย การจ้างเหมาเอกชนดำเนินการเดินระบบบำบัดน้ำเสียที่มีอยู่ในปัจจุบันและจะดำเนินจัดตั้งใหม่ในอนาคต
ปฏิบัติหน้าที่อื่นที่เกี่ยวข้อง โดยดูแลระบบบำบัดน้ำเสียในความรับผิดชอบ คือ โรงควบคุมคุณภาพน้ำขนาดใหญ่
4 แห่ง ได้แก่ ศูนย์การศึกษาและอนุรักษ์สิ่งแวดล้อมบางซื่อกรุงเทพมหานคร โรงควบคุมคุณภาพน้ำดินแดง โรงควบคุมคุณภาพน้ำรัตนโกสินทร์ โรงควบคุมคุณภาพน้ำจตุจักร โรงควบคุมคุณภาพน้ำขนาดชุมชน
7 แห่ง ได้แก่ โรงควบคุมคุณภาพน้ำบางบัว
โรงควบคุมคุณภาพน้ำพระราม 9
โรงควบคุมคุณภาพน้ำมักกะสัน โรงควบคุมคุณภาพน้ำห้วยขวาง โรงควบคุมคุณภาพน้ำทุ่งสองห้อง 1 โรงควบคุมคุณภาพน้ำทุ่งสองห้อง 2 และโรงควบคุมคุณภาพน้ำท่าทราย รวมทั้งควบคุม ป้องกัน ตรวจสอบ เฝ้าระวังและแก้ไขคุณภาพน้ำในแหล่งรับน้ำสาธารณะในเขตต่าง
ๆ ได้แก่ ดุสิต พระนคร ราชเทวี พญาไท บางซื่อ ดินแดง วัฒนา ห้วยขวาง ลาดพร้าว วังทองหลาง หลักสี่
บางเขน ดอนเมือง สายไหม จตุจักร และป้อมปราบศัตรูพ่าย