มีหน้าที่รับผิดชอบในการจัดการคุณภาพน้ำในพื้นที่กรุงเทพมหานคร โดยศึกษา ค้นคว้า ตรวจสอบ สถานการณ์มลพิษทางน้ำในพื้นที่กรุงเทพมหานคร รวบรวมข้อมูล วิเคราะห์ความรุนแรงของปัญหา แก้ไขปัญหามลภาวะทางน้ำ โดยกำหนดเป็นแผนหลักและยุทธศาสตร์ในการดำเนินการอย่างเป็นระบบ กำหนดมาตรการต่าง ๆ ในการจัดการปัญหา มลภาวะทางน้ำ กำหนดโครงการแก้ไขปัญหาน้ำเสียตามลำดับความสำคัญและความรุนแรงของปัญหาให้ครอบคลุมพื้นที่ที่เป็นปัญหามลภาวะทางน้ำของกรุงเทพมหานคร วางแผนการจัดการคุณภาพน้ำ ศึกษาความเหมาะสมในการดำเนินการ ดำเนินโครงการทั้งการออกแบบก่อสร้าง เดินระบบบำบัดน้ำเสียให้ได้ตามหลักวิชาและมาตรฐานการบำบัดน้ำทิ้ง ศึกษาพัฒนาระบบบำบัดน้ำเสียแบบต่าง ๆ ทั้งขนาดเล็ก ขนาดกลาง กำหนดมาตรฐานการออกแบบระบบบำบัดน้ำเสียแบบต่าง ๆ เสนอแนะแนวทางการจัดการคุณภาพน้ำทางวิศวกรรม ควบคุมการบริหารการก่อสร้างโครงการบำบัดน้ำเสียต่าง ๆ ควบคุมการเดินระบบและบำรุงรักษาโรงควบคุมคุณภาพน้ำ ตลอดจนดูแล บำรุงรักษาระบบท่อรวบรวมน้ำเสียในความรับผิดชอบ เฝ้าระวัง ดูแล รักษา อนุรักษ์แหล่งน้ำสาธารณะ คูคลอง และแม่น้ำเจ้าพระยา ตรวจสอบคุณภาพน้ำทิ้งจากอาคารสถานประกอบการต่าง ๆ ที่เป็นแหล่งกำเนิดน้ำเสียตามที่หน่วยงานที่เกี่ยวข้องร้องขอ พร้อมทั้งให้ข้อเสนอแนะ บริหารการจัดเก็บค่าธรรมเนียมบำบัดน้ำเสีย ปลูกจิตสำนึกให้ประชาชนตระหนักในปัญหามลภาวะทางน้ำและสร้างความมีส่วนร่วมของภาคประชาชนในการแก้ไขปัญหามลภาวะทางน้ำและการจัดการคุณภาพน้ำ โดยฝึกอบรมหรือเผยแพร่ความรู้ผ่านสื่อต่าง ๆ ประยุกต์เทคโนโลยีที่เหมาะสมมาใช้ในการจัดการคุณภาพน้ำ นำเทคโนโลยีสารสนเทศมาปรับปรุงพัฒนาทั้งระบบ นับแต่การจัดเก็บข้อมูล การจัดทำแผนที่ทางภูมิศาสตร์ (GIS) การออกแบบระบบบำบัดน้ำเสียด้วยโปรแกรมคอมพิวเตอร์ การควบคุมดูแลระบบบำบัดน้ำเสียด้วย โปรแกรม SCADA หรืออื่น ๆ ตามความเหมาะสม ศึกษา ค้นคว้า วิจัย เพื่อพัฒนางานด้านต่าง ๆ ทั้งในห้องปฏิบัติการทางวิทยาศาสตร์ ในแหล่งน้ำต่าง ๆ ระบบท่อรวบรวมน้ำเสีย ระบบบำบัดน้ำเสีย ระบบจัดการตะกอน แหล่งกำเนิดน้ำเสีย เพื่อพัฒนางาน จัดการคุณภาพน้ำ โดยมุ่งเน้นการใช้เทคโนโลยีสะอาดเพื่อการพัฒนาอย่างยั่งยืน นอกจากนี้ ต้องดำเนินการยกระดับ คุณภาพบุคลากรให้สามารถปฏิบัติงาน ในบทบาทของผู้ควบคุม ตรวจสอบ แนะนำ ให้คำปรึกษาร่วมกับภาคเอกชนใน การดำเนินการจัดการคุณภาพน้ำ นอกเหนือจากการเป็นผู้ปฏิบัติงานควบคุมดูแลด้านเดียว และปฏิบัติหน้าที่อื่นที่เกี่ยวข้อง
ผังโครงสร้างองค์กร
ภารกิจหน้าที่ของหน่วยงานใน
1. ฝ่ายบริหารงานทั่วไป
2. ส่วนวิชาการจัดการคุณภาพน้ำ
- กลุ่มงานวิเคราะห์คุณภาพน้ำ
- กลุ่มงานโครงการและจัดการตะกอน
- กลุ่มงานระบบข้อมูลและบริหารการจัดเก็บค่าธรรมเนียม
- กลุ่มงานพัฒนาระบบบำบัดน้ำเสีย
3. ส่วนปฏิบัติการจัดการคุณภาพน้ำ
- กลุ่มงานควบคุมคุณภาพน้ำ 1
- กลุ่มงานควบคุมคุณภาพน้ำ 2
- กลุ่มงานควบคุมคุณภาพน้ำ 3
- กลุ่มงานซ่อมบำรุงระบบรวบรวมน้ำเสีย
